ゲームシステム
今回はマルチシナリオストーリーを導入し、多分岐によってシナリオが異なる。戦闘は、ファイター(戦闘機。アーウィン等）による戦闘のみで、前作で使われたパイロットの戦闘やランドマスターは廃止している。
タッチペンによる操作方式や戦略シミュレーションの要素を盛り込んだ本作は多くの支持を集めた。一方で「タッチペン以外での操作方法が無い」「シューティングなのかシミュレーションなのかどっちつかず」といった不満も少なくなく、好みが分かれる作品である。しかし、多くのファンが批判する『アドベンチャー』『アサルト』よりは遥かに評価されており、「『アサルト』よりずっとましである」として本作の健闘を率直に評価するファンも少なくない。
キャラクター
フォックス・マクラウド
本編の主人公。雇われ遊撃隊スターフォックスのリーダーであったが、メンバー達が次々と離れていったため、現在はナウスと2人で行動している。
専用機はアーウィンII。
ファルコ・ランバルディ
スターフォックスの遊撃手であったが、現在はチームを離れ、暴走族時代の仲間と、宇宙を飛び回っている。
専用機はスカイクロー。
スリッピー・トード
フォックスの古くからの親友。現在はアマンダという恋人ができ、その生活を優先させている。
専用機はブルフロッグ。
クリスタル
フォックスの恋人であったが、危険な仕事に巻き込みたくない、というフォックスの意志に反発し、自ら脱退。ウルフたちのメンバーになっている。ストーリーの展開によってはアンドルフとの戦いの意義の根幹を揺るがしかねない発言をすることも･･･
専用機はクラウドランナー。
ペッピー・ヘア
すでにパイロットは引退しており、現在はペパー前将軍の推薦で、コーネリアの将軍の座についている。
専用機はアーウィン。
ルーシー・ヘア
ペッピーの娘。宇宙物理学の教師
母親（ペッピーの妻）の名前はビビアン・ヘア。
専用機はスカイバニー。
アマンダ
スリッピーの恋人。アマンダがスリッピーにほれたらしい。
専用機はタッドポール。
アッシュ・ボウマン
コーネリア軍のパイロット。スターフォックスに憧れを抱いている。実はアンドルフの孫である。
専用機はモンキーアロー。
ビル・グレイ
コーネリア軍のパイロット。フォックスとは宇宙アカデミー時代からの友人同士である。
専用機はコーネリアファイター。
キャット・モンロー
ファルコの宇宙暴走族仲間だった猫。一見気まぐれに見えるが、ファルコに気があるらしい。
専用機はスクラムジェット。
ジェームズ･マクラウド
フォックスの父親。アンドルフとの戦いで仲間（ピグマ）の裏切りにより死亡したはずだったが･･･
専用機はアーウィン。
ウルフ・オドネル
フォックスの永遠のライバルであり、スターウルフのヘッド。現在は指名手配となり、多額の懸賞金をかけられている。
専用機はウルフェン。
レオン・ポワルスキー
冷徹なウルフの相棒。現在のスターウルフの中ではウルフに並んで古株。
専用機はレインボーデルタ。
パンサー・カルロッソ
アサルトに引き続き登場する、キザなスターウルフの一員。
相変わらずクリスタルに惚れ込んでおり、今作でもアタックを続けている。
専用機はブラックローズ。
ベルツィーノ・トード
コーネリアの科学者でスリッピーの父親。アングラー一味がアンドルフのバイオウェポン研究の産物であることを突き止める。
アンドリュー・オイッコニー
前作では亡き叔父アンドルフの残党を率いてコーネリア政府に反旗を翻したが、スターフォックスによって倒された。が、今作でも生きていることが判明。今回はアングラー軍として再びフォックスの前に立ちふさがる。
ピグマ・デンガー
前作においてアパロイドに取り付かれて死亡したと思われたが、アパロイドの影響なのか巨大メカと一体化して生き延びており、またしてもフォックスたちの邪魔をしてくる。
アングラー皇帝
アンドルフやアパロイドに代わり、ライラット系に襲い掛かる悪の皇帝。ベノムの硝酸の海を本拠地に、フォックスたちに、手ごわい攻撃を仕掛ける。
オクトマン
アングラーの部下。その名のとおり、タコの姿をしている。元々はF-ZEROシリーズのキャラクターである。F-ZEROとスターフォックスの両作品に出演したのは、ジェームズ・マクラウドに続いて二人目。
ザザン
アングラーの部下。半魚人のような姿をしている。アングラーと真近で話しているところをみるとかなりの側近であろう。オクトマンと共に専用機でフォックスたちに戦いを挑む。
ゾルゲ
アングラーの部下。見た目はイカの姿である。アングラーから巨大レーザー兵器を預かっている。
シャーマン
アングラーの部下。見た目はシュモクザメの姿である。搭乗する戦闘機もやはりサメ形である。
今回はマルチシナリオストーリーを導入し、多分岐によってシナリオが異なる。戦闘は、ファイター(戦闘機。アーウィン等）による戦闘のみで、前作で使われたパイロットの戦闘やランドマスターは廃止している。
タッチペンによる操作方式や戦略シミュレーションの要素を盛り込んだ本作は多くの支持を集めた。一方で「タッチペン以外での操作方法が無い」「シューティングなのかシミュレーションなのかどっちつかず」といった不満も少なくなく、好みが分かれる作品である。しかし、多くのファンが批判する『アドベンチャー』『アサルト』よりは遥かに評価されており、「『アサルト』よりずっとましである」として本作の健闘を率直に評価するファンも少なくない。
キャラクター
フォックス・マクラウド
本編の主人公。雇われ遊撃隊スターフォックスのリーダーであったが、メンバー達が次々と離れていったため、現在はナウスと2人で行動している。
専用機はアーウィンII。
ファルコ・ランバルディ
スターフォックスの遊撃手であったが、現在はチームを離れ、暴走族時代の仲間と、宇宙を飛び回っている。
専用機はスカイクロー。
スリッピー・トード
フォックスの古くからの親友。現在はアマンダという恋人ができ、その生活を優先させている。
専用機はブルフロッグ。
クリスタル
フォックスの恋人であったが、危険な仕事に巻き込みたくない、というフォックスの意志に反発し、自ら脱退。ウルフたちのメンバーになっている。ストーリーの展開によってはアンドルフとの戦いの意義の根幹を揺るがしかねない発言をすることも･･･
専用機はクラウドランナー。
ペッピー・ヘア
すでにパイロットは引退しており、現在はペパー前将軍の推薦で、コーネリアの将軍の座についている。
専用機はアーウィン。
ルーシー・ヘア
ペッピーの娘。宇宙物理学の教師
母親（ペッピーの妻）の名前はビビアン・ヘア。
専用機はスカイバニー。
アマンダ
スリッピーの恋人。アマンダがスリッピーにほれたらしい。
専用機はタッドポール。
アッシュ・ボウマン
コーネリア軍のパイロット。スターフォックスに憧れを抱いている。実はアンドルフの孫である。
専用機はモンキーアロー。
ビル・グレイ
コーネリア軍のパイロット。フォックスとは宇宙アカデミー時代からの友人同士である。
専用機はコーネリアファイター。
キャット・モンロー
ファルコの宇宙暴走族仲間だった猫。一見気まぐれに見えるが、ファルコに気があるらしい。
専用機はスクラムジェット。
ジェームズ･マクラウド
フォックスの父親。アンドルフとの戦いで仲間（ピグマ）の裏切りにより死亡したはずだったが･･･
専用機はアーウィン。
ウルフ・オドネル
フォックスの永遠のライバルであり、スターウルフのヘッド。現在は指名手配となり、多額の懸賞金をかけられている。
専用機はウルフェン。
レオン・ポワルスキー
冷徹なウルフの相棒。現在のスターウルフの中ではウルフに並んで古株。
専用機はレインボーデルタ。
パンサー・カルロッソ
アサルトに引き続き登場する、キザなスターウルフの一員。
相変わらずクリスタルに惚れ込んでおり、今作でもアタックを続けている。
専用機はブラックローズ。
ベルツィーノ・トード
コーネリアの科学者でスリッピーの父親。アングラー一味がアンドルフのバイオウェポン研究の産物であることを突き止める。
アンドリュー・オイッコニー
前作では亡き叔父アンドルフの残党を率いてコーネリア政府に反旗を翻したが、スターフォックスによって倒された。が、今作でも生きていることが判明。今回はアングラー軍として再びフォックスの前に立ちふさがる。
ピグマ・デンガー
前作においてアパロイドに取り付かれて死亡したと思われたが、アパロイドの影響なのか巨大メカと一体化して生き延びており、またしてもフォックスたちの邪魔をしてくる。
アングラー皇帝
アンドルフやアパロイドに代わり、ライラット系に襲い掛かる悪の皇帝。ベノムの硝酸の海を本拠地に、フォックスたちに、手ごわい攻撃を仕掛ける。
オクトマン
アングラーの部下。その名のとおり、タコの姿をしている。元々はF-ZEROシリーズのキャラクターである。F-ZEROとスターフォックスの両作品に出演したのは、ジェームズ・マクラウドに続いて二人目。
ザザン
アングラーの部下。半魚人のような姿をしている。アングラーと真近で話しているところをみるとかなりの側近であろう。オクトマンと共に専用機でフォックスたちに戦いを挑む。
ゾルゲ
アングラーの部下。見た目はイカの姿である。アングラーから巨大レーザー兵器を預かっている。
シャーマン
アングラーの部下。見た目はシュモクザメの姿である。搭乗する戦闘機もやはりサメ形である。
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